Charlton U21 er et fotballag for unge spillere som representerer Charlton Athletic Football Club i Premier League 2, den høyeste ligaen for spillere under 21 år i England. Laget består av spillere som er mellom 18 og 21 år gamle, og det fungerer som et viktig mellomledd mellom klubbens ungdomsakademi og førstelaget.

Charlton U21 har en rik historie og har produsert en rekke talentfulle spillere som har gått videre til å spille på toppnivå. Laget har vunnet Premier League 2-tittelen én gang, i 2009–10-sesongen, og har også vært finalist ved tre andre anledninger.

Nåværende manager for Charlton U21 er Johnnie Jackson, en tidligere Charlton-spiller som også har vært assisterende manager for førstelaget. Laget spiller sine hjemmekamper på The Valley, som også er hjemmebanen til klubbens førstelag.

Noen av de mest kjente spillerne som har kommet gjennom Charlton U21-systemet inkluderer:

* Darren Bent
* Joe Cole
* Scott Parker
* John Terry
* Ashley Cole
* Declan Rice