FK Stupino er en russisk fotballklubb fra byen Stupino. Klubben ble grunnlagt i 1946 og spiller i den tredje divisjonen i det russiske ligasystemet. Stupinos hjemmebane er SKA Stadium, som har en kapasitet på 3 500 tilskuere.

Klubben har hatt en beskjeden historie og har aldri spilt i den øverste divisjonen i Russland. Deres beste prestasjon var å nå kvartfinalen i den russiske cupen i 2001.

I 2015 ble klubben oppløst på grunn av økonomiske problemer. I 2016 ble klubben gjenopprettet og spiller nå i den tredje divisjonen.

Stupinos nåværende trener er Aleksandr Grigoryan.

Klubbens farger er blå og hvit.